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我國(guó)研發(fā)CoHIT檢測(cè)平臺(tái)：一種簡(jiǎn)便、快速、精準(zhǔn)的CRISPR基因檢測(cè)技術(shù)
2024年06月27日 16:04:42
來(lái)源：化工儀器網(wǎng) 點(diǎn)擊量：8951
中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研發(fā)一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測(cè)平臺(tái)，該平臺(tái)能夠快速、精準(zhǔn)地檢測(cè)同一基因位點(diǎn)上多種不同類型的突變（indels）。
【化工儀器網(wǎng) 項(xiàng)目成果】中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所(嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實(shí)驗(yàn)室深圳分中心)攜手武漢大學(xué)中南醫(yī)院，在《自然·通訊(Nature Communications)》期刊上發(fā)表了一項(xiàng)重大研究成果。該論文題為“CoHIT: a one-pot ultrasensitive ERA-CRISPR system for detecting multiple same-site indels”，介紹了一種名為CoHIT的新型CRISPR檢測(cè)平臺(tái)，該平臺(tái)能夠快速、精準(zhǔn)地檢測(cè)同一基因位點(diǎn)上多種不同類型的突變(indels)。
快速靈敏檢測(cè)技術(shù)對(duì)疾病防控必不可少近年來(lái)，以CRISPR/Cas為代表的基因編輯技術(shù)帶來(lái)了生物技術(shù)革命性的進(jìn)步。CRISPR的核酸檢測(cè)技術(shù)因其快速、準(zhǔn)確、靈敏、經(jīng)濟(jì)等特點(diǎn)，正在引發(fā)分子診斷革新，并已被成功應(yīng)用于傳染病、遺傳病、腫瘤基因突變?cè)\斷，以及食品安全等領(lǐng)域。
但現(xiàn)有的檢測(cè)方法在應(yīng)對(duì)同一基因位點(diǎn)的多種indels時(shí)往往存在檢測(cè)覆蓋率不足的局限性。為了克服這一挑戰(zhàn)，研究團(tuán)隊(duì)利用蛋白進(jìn)化技術(shù)，篩選出高耐受度的Cas蛋白，并結(jié)合單一crRNA識(shí)別多種突變類型的創(chuàng)新理念，成功構(gòu)建了CoHIT檢測(cè)平臺(tái)。
CoHIT系統(tǒng)的核心在于一種改良的AsCas12a蛋白，即enAsU-R。這種蛋白僅需一條crRNA就能靶向多個(gè)不同的變異體，有效提高了檢測(cè)的靈敏度和特異性。通過(guò)一系列參數(shù)優(yōu)化，CoHIT技術(shù)對(duì)NPM1基因突變的常見亞型達(dá)到了0.01%的檢測(cè)靈敏度，并在30分鐘內(nèi)快速給出結(jié)果，為急性髓系白血病(AML)患者的NPM1突變檢測(cè)提供了新的解決方案，且在監(jiān)測(cè)微小殘留病灶(MRD)方面展現(xiàn)了巨大的潛力。
值得一提的是，CoHIT技術(shù)還具備出色的適應(yīng)性和多重檢測(cè)能力。通過(guò)與側(cè)向流檢測(cè)條(LFA)和微流控芯片的結(jié)合，該技術(shù)不僅實(shí)現(xiàn)了現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)，還能夠在一次上樣中同時(shí)檢測(cè)多個(gè)靶標(biāo)，為疾病的早期診斷和食品安全監(jiān)測(cè)等領(lǐng)域提供了強(qiáng)大的技術(shù)支持。
CoHIT技術(shù)的成功研發(fā)和不斷優(yōu)化，不僅簡(jiǎn)化了檢測(cè)流程，還大大提升了檢測(cè)速度與準(zhǔn)確性，為分子育種、疾病早期診斷、遺傳病篩查和食品安全監(jiān)測(cè)等眾多領(lǐng)域提供了強(qiáng)有力的工具。
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