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面向大數(shù)據(jù)的生物信息云
點(diǎn)擊次數(shù)：1071 發(fā)布時間：2013-3-22
面向大數(shù)據(jù)的生物信息云
云計算是一種通過Internet以服務(wù)的方式提供動態(tài)可伸縮的虛擬化的資源的計算模式。現(xiàn)今，隨著高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展，生物信息學(xué)進(jìn)入到大數(shù)據(jù)時代，所引發(fā)的多組學(xué)海量生物數(shù)據(jù)的存儲和分析等問題亟待需要利用云的方式來解決。
近期，中國科學(xué)院北京基因組研究所基因組科學(xué)與信息重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的“百人計劃”章張研究員，與沙特阿卜杜拉國王科技大學(xué)（King Abdullah University of Science and Technology）、北京理工大學(xué)、IBM中國系統(tǒng)與科技中心開展合作研究，在Biology Direct雜志上發(fā)表了題為Bioinformatics clouds for big data manipulation的學(xué)術(shù)論文。文中分析了現(xiàn)有生物信息學(xué)領(lǐng)域的云計算服務(wù)（簡稱：生物信息云），根據(jù)其服務(wù)特點(diǎn)提出分類方法：數(shù)據(jù)即服務(wù)（DaaS，Data as a Service）、軟件即服務(wù)（SaaS，Software as a Service）、平臺即服務(wù)（PaaS，Platform as a Service）以及基礎(chǔ)設(shè)施即服務(wù)（IaaS，Infrastructure as a Service）。
生物信息云從四個方面提供了海量生物數(shù)據(jù)的儲存、獲取、分析等相關(guān)需求的服務(wù)。同時，文中對云計算在生物信息學(xué)的應(yīng)用進(jìn)行了展望和討論，提出并分析了以下幾個亟需解決問題，即生物信息云應(yīng)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)和軟件的云儲存，結(jié)合的高速傳輸、P2P、數(shù)據(jù)壓縮等大數(shù)據(jù)的傳輸，開發(fā)基于云的輕量型編程環(huán)境，以及建立開放的生物信息學(xué)云平臺。