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雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)~實驗操作篇

2021-10-12  閱讀(377)

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雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)~實驗操作篇



自1990年螢光素酶生物傳感器技術(shù)誕生以來,單螢光素酶檢測系統(tǒng)到雙螢光素酶檢測系統(tǒng)的發(fā)展,為科研人員提供了更為嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶嶒炇侄?。雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)在單報告基因的基礎(chǔ)上引入了“內(nèi)參對照"報告基因,可以排除不同組之間細(xì)胞生長狀況、細(xì)胞數(shù)目以及轉(zhuǎn)染效率帶來的干擾,起到校正的作用,從而使實驗結(jié)果更為可靠。今天小翌將從雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)的原理與應(yīng)用開篇,給大家分享雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)的實驗操作流程。


雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)原理



螢火蟲螢光素酶是一種胞內(nèi)蛋白,大小為61KDa。在氧氣、ATP和鎂離子同時存在的條件下,催化底物螢火蟲螢光素氧化,生成氧化螢光素,并發(fā)出黃綠色光,其*發(fā)光波長為560nm。



海腎螢光素酶也是一種胞內(nèi)蛋白,大小為36KDa。只需要氧氣就可以催化腔腸素,氧化生成高能產(chǎn)物coelenteramide,并發(fā)出藍(lán)光,其*發(fā)光波長為465nm


海腎熒光素酶.jpg





雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)應(yīng)用

◆ microRNA研究

在報告基因的3'端加上目的基因的3'UTR,就能用來檢測miRNA對于目的基因的調(diào)控(抑制作用),報告基因表達(dá)越少,說明miRNA的作用就越強(qiáng)。

◆ 轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究

在報告基因的5'端加上待檢測基因的啟動子,就可以用來檢測轉(zhuǎn)錄因子對啟動子的作用,啟動轉(zhuǎn)錄越多,那報告基因的表達(dá)量就越大,熒光值越高。

◆ 啟動子研究

將啟動子區(qū)域序列進(jìn)行分段截短,或?qū)μ囟ㄎ稽c(diǎn)進(jìn)行突變,再分別構(gòu)建到luciferase報告載體中,檢測其啟動子活性。

◆ 信號通路研究

信號通路的激活/監(jiān)測基因的表達(dá)水平。


......





雙螢光素酶報告基因檢測實驗操作流程



報告基因檢測流程主要有4個模塊:分別是質(zhì)粒構(gòu)建、細(xì)胞轉(zhuǎn)染、報告基因檢測和數(shù)據(jù)分析。



質(zhì)粒構(gòu)建


雙螢光素酶報告基因系統(tǒng)一般將螢火蟲螢光素酶報告基因質(zhì)粒和海腎螢光素酶報告基因質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,或?qū)⑦@兩個報告基因構(gòu)建到同一個骨架質(zhì)粒上(如pGL4質(zhì)粒),分別用不同的啟動子啟動其表達(dá)。


◆ 主報告基因載體的選擇

根據(jù)實驗?zāi)康倪x擇對應(yīng)的載體骨架。

如果是基因調(diào)控研究,需要選擇不帶啟動子或其他調(diào)控元件的骨架載體。如果研究啟動子強(qiáng)弱或轉(zhuǎn)錄因子對啟動子的作用,那么就在該螢光素酶的5'端加上待檢測啟動子序列或者有轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的啟動子(下圖左)。如果想檢測miRNA對于目的基因的抑制作用,就可以在螢光素酶3'端加上目的基因的3'UTR(下圖右)。


3'UTR-1.jpg

3'UTR-2.jpg


◆ 內(nèi)參報告基因載體的選擇

帶有表達(dá)組成型啟動子的螢光素酶表達(dá)載體作為內(nèi)參。

不同的載體帶有的啟動子不同,通常啟力:CMV>SV40>PGK>TK。通常內(nèi)參基因表達(dá)的活性應(yīng)當(dāng)顯著的高于背景組,同時,盡量小,確保不干擾主報告基因的表達(dá)。所以一般選擇內(nèi)參載體時,首先考慮活性較弱的TK啟動子載體,如果表達(dá)量過低,再考慮其他類型的啟動子或者構(gòu)建自己需要特殊的啟子。



細(xì)胞轉(zhuǎn)染


◆ 轉(zhuǎn)染細(xì)胞系選擇

根據(jù)不同細(xì)胞系大小和生長速度選擇初始密度(混合度在80-90%)。

◆ 轉(zhuǎn)染方法選擇

根據(jù)實驗?zāi)康倪x擇瞬時轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染。對于短期表達(dá)的目的基因產(chǎn)物,可以選用瞬時轉(zhuǎn)染法,操作更為簡便。對于需要長期穩(wěn)定表達(dá)目的基因產(chǎn)物,建議選用穩(wěn)定轉(zhuǎn)染法,穩(wěn)定性更好。

◆ 轉(zhuǎn)染報告基因比例

主報告基因:內(nèi)參報告基因=10:1-100:1。

◆ 啟動子和轉(zhuǎn)錄因子比例

啟動子和轉(zhuǎn)錄因子比例一般為1:9。

◆ 核酸與轉(zhuǎn)染試劑的比例

從1:2開始調(diào)整,另外,注意質(zhì)粒的純度、完整度和去內(nèi)毒素。





報告基因檢測


◆ 檢測試劑選擇


◆ 檢測板選擇



◆ 檢測儀器選擇


檢測儀器:發(fā)光檢測儀(Luminometer),或帶有發(fā)光檢測模塊的多功能酶標(biāo)儀。
發(fā)光模式:化學(xué)發(fā)光(Luminescence)。
檢測類別:終點(diǎn)法檢測。
波長范圍:無需設(shè)置波長,如需選擇,推薦全波長380-780 nm。
注:只選擇在最大波長處檢測發(fā)光,過濾掉其他發(fā)光信號,意味著檢測會丟掉很多信號,丟失靈敏度。
讀取模式:底讀或頂讀。

檢測時間:輝光型0.5-1 sec,閃光型2-10 sec。





數(shù)據(jù)分析


通過儀器可以直接讀出螢火蟲和海腎螢光素酶的數(shù)值,兩種熒光值讀數(shù)不少于4位數(shù),讀數(shù)大于8位數(shù)時,需要稀釋裂解上清(讀數(shù)與細(xì)胞種類、細(xì)胞狀態(tài)、轉(zhuǎn)染方法、轉(zhuǎn)染時間等因素相關(guān))。

相對表達(dá)倍數(shù)具體計算公式如下:

歸一化值=螢火蟲螢光素酶讀值(主報告基因)/海腎螢光素酶讀值(內(nèi)參基因)

相對表達(dá)倍數(shù)=實驗組歸一化值/對照組歸一化值

給大家舉個例子:

分類

F-Luc

R-Luc

歸一化(F/R)

平均值

相對表

達(dá)倍數(shù)

對照組1

20118

50201

0.400748989

0.420043613

1

對照組2

18919

48091

0.393400012

對照組3

21910

47019

0.465981837

實驗組1

60129

60911

0.987161596

1.226184349

2.919183

實驗組2

87927

56873

1.546023596

實驗組3

78791

68791

1.145367853

通過計算以上公式計算,實驗組表達(dá)量是對照組的2.92倍。

寫到這里,雙螢光素酶報告基因檢測系統(tǒng)的實驗操作篇就給大家分享完了,大家對這個實驗是否有更進(jìn)一步的了解啦!如果您在實驗操作過程中還有其他問題歡迎留言哦~


下期小翌將會結(jié)合大家的留言進(jìn)一步分享~


最后小翌給大家分享一下Yeasen螢光素酶報告基因檢測的解決方案,每一步都能幫到您!









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