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  • 如何定量低豐度目的基因的表達(dá)(含詳細(xì)解決方法)

    有時(shí)候,qPCR實(shí)驗(yàn)會(huì)成為阻礙你課題順利開展的強(qiáng)勢(shì)攔路虎!看似簡(jiǎn)單的基因表達(dá)量差異驗(yàn)證,當(dāng)遇到低豐富表達(dá)的基因時(shí),也許就舉步維艱。模板獲取困難導(dǎo)致的RNA提取量少或RNA質(zhì)量不佳,即使選用蕞佳的試劑、篩選出良好的引物,也有可能qPCR定量得到的內(nèi)參基因CT值在18-20個(gè)cycle,而目的基因在31-35個(gè)循環(huán)。遇到這種情況,你是怎么解決的呢?qPCR在低豐度表達(dá)基因定量中的局限性基因的豐度是指基因在基因組中的拷貝數(shù)??煞譃楦哓S度,中等豐度和低豐度。低豐度是指目的基因在基因組中的拷貝數(shù)低,可簡(jiǎn)單
  • 掌握這幾個(gè)影響因素,你的反轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)就了

    小翊君前幾期一直在和大家聊qPCR,今天我們開啟一個(gè)新的話題,聊一聊反轉(zhuǎn)錄。反轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)定義:反轉(zhuǎn)錄過(guò)程簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)是以RNA為模板合成DNA的過(guò)程,是對(duì)中心法則的重要修正和補(bǔ)充。中心法則通常會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)不同的表述,逆轉(zhuǎn)錄和反轉(zhuǎn)錄,二者的本質(zhì)區(qū)別在于:反轉(zhuǎn)錄是在研究過(guò)程中人為提取RNA并以之為模板人工合成DNA的過(guò)程。逆轉(zhuǎn)錄是RNA病毒自主行為,以RNA為模板形成DNA的過(guò)程。前者發(fā)生在體外,后者發(fā)生在體內(nèi)。反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的示意圖如下圖所示:反轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程看似簡(jiǎn)單的反
  • 牛血清白蛋白系列產(chǎn)品

    牛血清白蛋白、免疫球蛋白G(IgG)、牛凝血酶、轉(zhuǎn)鐵蛋白、胰島素、封閉血清和低密度脂蛋白YEASEN(翊圣生物)致力于為診斷試劑公司和廣大科研用戶提供高品質(zhì)的牛血清白蛋白、免疫球蛋白G(IgG)、牛凝血酶、轉(zhuǎn)鐵蛋白、胰島素、封閉血清和低密度脂蛋白,系列產(chǎn)品如下:(一)牛血清白蛋白(BSA)牛血清白蛋白(BovineSerumAlbumin,BSA)是牛血清中的一種球蛋白,又稱第五組分(需要注意的是,第五組分并不是BSA的一種組份,而是EdwinJ.Cohn教授早期從血液中通過(guò)特定的分離技術(shù)得到5
  • qPCR進(jìn)階攻略——帶你玩轉(zhuǎn)儀器設(shè)置!

    熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)是分子實(shí)驗(yàn)室常用的一項(xiàng)技術(shù)。持續(xù)關(guān)注小翊的應(yīng)該都掌握了高質(zhì)量cDNA的獲取方法,引物設(shè)計(jì)指南以及反應(yīng)體系的配制技巧(還未get的小伙伴戳文末鏈接),然而上機(jī)時(shí),發(fā)現(xiàn)和別人的反應(yīng)條件不一致卻又不敢動(dòng)儀器?本期小翊將帶你玩轉(zhuǎn)qPCR儀器的設(shè)置!目前市面上的qPCR儀器種類五花八門,但基本上儀器的設(shè)置都相對(duì)一致。我們以ABI7500為例進(jìn)行介紹。反應(yīng)板設(shè)置實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇:我們將實(shí)驗(yàn)命名為“Yeasen”,進(jìn)行“Quantitation:ΔΔCt”實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)方法選擇:如選用SYBRGre
  • 逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)做不好,是不是引物出了問(wèn)題?

    實(shí)驗(yàn)室常用到的實(shí)驗(yàn):逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)人員通過(guò)體外模擬病毒復(fù)制過(guò)程,以提取的RNA為模板,使用逆轉(zhuǎn)錄酶催化,合成出與RNA互補(bǔ)的cDNA鏈。終構(gòu)建cDNA文庫(kù),并從中篩選所需的靶標(biāo)基因。BUT!小伙伴們做逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)時(shí),1)有沒(méi)有深究過(guò)RNA逆轉(zhuǎn)錄出的cDNA能不能真實(shí)反映出基因表達(dá)信息?2)做實(shí)驗(yàn)時(shí),有沒(méi)有發(fā)生過(guò)內(nèi)參做的很好,目的基因做不出的情況?如果有發(fā)生上述情況,那么需要重新評(píng)估逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果的有效性。逆轉(zhuǎn)錄結(jié)果有效性的評(píng)定逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果有效性的評(píng)定重要的是盡可能反映樣本中原始RNA模板的信息,
  • 測(cè)序數(shù)據(jù)不好?是不是建庫(kù)出了問(wèn)題?!

    HB190313測(cè)序數(shù)據(jù)不好?是不是建庫(kù)出了問(wèn)題?!——從測(cè)序數(shù)據(jù)看文庫(kù)構(gòu)建高通量測(cè)序中的文庫(kù)構(gòu)建指的是在DNA兩端連接特定的接頭從而使其符合測(cè)序平臺(tái)要求的過(guò)程,在高通量測(cè)序過(guò)程中,文庫(kù)質(zhì)量直接影響終測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量,打個(gè)比方,如果文庫(kù)上機(jī)測(cè)序的濃度很低,樣本在FlowCell上擴(kuò)增所形成的DNA樣本簇就會(huì)很少,測(cè)序數(shù)據(jù)量也將減少,這就可能導(dǎo)致測(cè)序失敗,所以我們說(shuō)文庫(kù)的質(zhì)量控制和質(zhì)量評(píng)估也是NGS中的關(guān)鍵步驟。文庫(kù)如何質(zhì)控?評(píng)估文庫(kù)質(zhì)量的方法有哪些?n文庫(kù)質(zhì)控:文庫(kù)在上機(jī)之前都有會(huì)進(jìn)行質(zhì)量檢測(cè),質(zhì)
  • 這有一份FFPE樣本建庫(kù)的檔案,還不趕緊Pick?

    這有一份FFPE樣本建庫(kù)的檔案,還不趕緊Pick?什么是FFPE?FFPE(Formalin-FixedandParrffinEmbedded),即福爾馬林固定石蠟包埋樣本。由于這種處理方法能夠較長(zhǎng)時(shí)間地保存組織或制備檢驗(yàn)所需的組織標(biāo)本,所以在臨床病理檢驗(yàn)、腫瘤基因檢測(cè)中應(yīng)用廣泛。在世界范圍內(nèi),大約有數(shù)十億份組織樣品保存在醫(yī)院或者組織樣品庫(kù)中,其中絕大多數(shù)是使用福爾馬林固定石蠟包埋的方法處理的樣品。FFPE樣本通常代表了珍貴且來(lái)源廣泛的生物醫(yī)學(xué)研究材料,為闡明疾病機(jī)制、回顧性研究等提供了寶貴的資
  • 系統(tǒng)介紹鏈脲佐菌素(STZ)誘導(dǎo)的糖尿病疾病模型

    翊圣生物提供高成功率糖尿病建模用STZ:純度≥98%(HPLC測(cè)定)。產(chǎn)品名稱貨號(hào)規(guī)格*(元)Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES60100mg156.00Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES76500mg386.00Streptozocin鏈脲佐菌素60256ES801g676.00文章包含以下知識(shí)點(diǎn)1.STZ誘導(dǎo)糖尿病模型的構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)SOP2.STZ誘導(dǎo)糖尿病模型建模效果評(píng)估指標(biāo)3.STZ誘導(dǎo)糖尿病模型的失敗原因解析4.STZ誘導(dǎo)小/大鼠死亡率高的原因解析5.糖尿病建模
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