在一項新的研究中，在加拿大多倫多大學(xué)唐納利中心的Charles Boone教授、Brenda Andrews教授和美國明尼蘇達(dá)大學(xué)雙城校區(qū)的Chad Myers教授的領(lǐng)導(dǎo)下，來自多個國家的研究人員在之前研究---展示了基因如何成對組合來維持細(xì)胞的健康---的基礎(chǔ)上更進一步，研究了三基因組合如何有助維持正常的細(xì)胞生理學(xué)特征。
圖片來自Raamesh Deshpande。
這非常類似于大型游戲Jenga，在這個游戲中，人們能夠移除數(shù)千個基因塊（gene block）。雖然大多數(shù)單個基因塊能夠在不影響結(jié)構(gòu)的情況下被移除，但是當(dāng)關(guān)鍵的基因塊組合被移除時，系統(tǒng)就會崩潰。類似地，具有不同作用的基因能夠組合起來保持細(xì)胞存活。通過取消這種基因組合，科學(xué)家們希望揭示有關(guān)個人健康基礎(chǔ)的線索。
為了揭示基因功能組合的規(guī)則，這些研究人員之前研究了酵母細(xì)胞中基因如何成對地發(fā)揮作用。酵母是生物學(xué)家們zui喜愛的細(xì)胞模型之一，這是因為它的基因組相對較小，含有6000個基因和已存在大量數(shù)據(jù)。之前已從酵母中除去了所有可能的基因?qū)Γ?800萬個基因?qū)Γ缃?，他們進一步研究了當(dāng)從360億個可能的三基因組合（trigenic combination）移除部分三基因組合時會發(fā)生什么。
這些研究人員發(fā)現(xiàn)，與兩個基因之間的相互作用相類似，三基因相互作用（即三個基因之間的相互作用）也主要發(fā)生在功能上相關(guān)的基因之間，比如它們編碼的蛋白片段屬于相同分子機器或存在于細(xì)胞的相同部分中。利用三基因相互作用，他們也開始在功能上不相關(guān)的并且參與細(xì)胞中不同生物過程的基因之間觀察到更多令人吃驚的合作關(guān)系。
此外，通過使用數(shù)學(xué)模型，這些研究人員估計當(dāng)將三基因相互作用考慮在內(nèi)時，細(xì)胞中的所有基因都有作用。 這可能zui終解釋為什么在酵母的6000個基因中僅十分之一的基因?qū)?xì)胞存活是至關(guān)重要的，這一規(guī)則也適用于包括人類細(xì)胞在內(nèi)的其他細(xì)胞類型。
由于近期基因編輯技術(shù)取得的進步，如今移除人類細(xì)胞中的基因組合是有可能的。當(dāng)前，Boone實驗室和Andrew實驗室正在與多倫多大學(xué)唐納利中心的Jason Moffat實驗室合作繪制人類致病基因之間的關(guān)系。（生物谷 Bioon.com）
參考資料：
Elena Kuzmin1,2,*,†, Benjamin VanderSluis3,*, Wen Wang et al. Systematic analysis of complex genetic interactions. Science, 20 Apr 2018, 360(6386):eaao1729, doi:10.1126/science.aao1729
Albertha J. M. Walhout. If two deletions don't stop growth, try three.Science, 20 Apr 2018, 360(6386):269-270, doi:10.1126/science.aat4667
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