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ChIP-seq染色質(zhì)圖譜檢測(cè)方法的局限性及改善方式

時(shí)間:2023/4/7閱讀:697
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ChIP-seq是最-廣泛使用的染色質(zhì)圖譜檢測(cè)方法,但有很大的局限性,具體表現(xiàn)為:

1.高細(xì)胞需求量;

2.低吞吐量;

3.技術(shù)困難;

4.高成本,深度測(cè)序;

5.數(shù)據(jù)質(zhì)量差,變量大


CUT&RUN和CUT&Tag檢測(cè)法正在取代ChIP-seq

簡(jiǎn)化的工作流程跳過(guò)了ChIP-seq實(shí)驗(yàn)法中的挑戰(zhàn)性步驟,包括染色質(zhì)片段化和抗體pull down,用更少的細(xì)胞和測(cè)序讀數(shù)得到更佳的數(shù)據(jù)。

ChIP-seq染色質(zhì)圖譜檢測(cè)方法的局限性及改善方式

具體變現(xiàn)為:

1.低細(xì)胞需求量;

2.高吞吐量;

3.操作流程更簡(jiǎn)易;

4.低成本,測(cè)序讀取次數(shù)更少;

5.數(shù)據(jù)質(zhì)量可靠,重復(fù)性好



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