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原代細胞核接頭蛋白LDB1是多蛋白轉(zhuǎn)錄復合體中的一個核心成分。Li等研究發(fā)現(xiàn), 在小鼠胚胎和成體造血干細胞中LDB1起到關(guān)鍵作用。在造血干細胞和前體細胞中敲除該基因會造成一些維持多能性相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄下調(diào), ChIP-Seq結(jié)果顯示, LDB1形成的復合體結(jié)合在這些基因的啟動子區(qū)域, 暗示 LDB1維持造血干細胞中起核心作用。
多能造血前體細胞是一種干細胞樣細胞, 表達各種基因, 且有分化成包括免疫系統(tǒng)細胞在內(nèi)的大量不同類型血細胞的能力。Zhang等利用ChIPSeq和RNA-seq技術(shù)在小鼠全基因組內(nèi)找出造血前體細胞轉(zhuǎn)化成定型T細胞中起作用的所有基因, 并確定了每個基因在發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄時間點。同時, 還追蹤了指引前體細胞到各種替代途徑中的基因。結(jié)果不僅揭示了T細胞發(fā)育過程的時空調(diào)控網(wǎng)絡(luò), 也表明了T細胞發(fā)育過程如何關(guān)閉啟動替代命運的基因。
少突膠質(zhì)細胞(oligodendrocyte, OL)是中樞神經(jīng)系統(tǒng)的髓鞘形成細胞, 原代細胞來源于其前體細胞。Olig2 是一種少突膠質(zhì)細胞轉(zhuǎn)錄因子, 與前體細胞增殖和向少突膠質(zhì)細胞分化密切相關(guān)。Yu等利用ChIPSeq進行全基因組分階段研究發(fā)現(xiàn)Olig2充當了一種預(yù)定位(prepatterning)因子, 引導染色質(zhì)重塑酶 Smarca4/Brg1到達少突膠質(zhì)細胞活性靶點, 從而通過Brg1激活少突膠質(zhì)細胞特定基因表達。Olig2和Brg1在染色質(zhì)上的結(jié)合還指導重要的表觀遺傳修飾信息, 并預(yù)測重要的少突膠質(zhì)細胞分化調(diào)控基因。
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