一、RNA提取 1、樣本裂解:
組織樣本: Trizol用量:每 50-100 mg 組織加 1 mL Trizol,樣品體積不應(yīng)超過(guò) Trizol 體積的 10%。 (1)將動(dòng)物或植物組織切成小塊,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理。 (2)將研磨好的組織粉末快速轉(zhuǎn)入裝有 1 mL Trizol 的 2 mL 離心管中,在渦旋振蕩器上迅速振蕩混勻,置于冰上, 待所有的樣品研磨完。 (3)裂解產(chǎn)物應(yīng)呈澄清的透明粘稠液體。對(duì)于富含蛋白、脂肪或多糖物質(zhì)的組織樣品如肌肉、脂肪組織和植物結(jié)節(jié)部位等,勻漿后仍會(huì)存留有不溶物質(zhì),可于 4℃ 12,000 x g 離心 10 min,然后吸取上清至一新的離心管中。
細(xì)胞樣本: (1)貼壁細(xì)胞:吸盡培養(yǎng)液,每 10 cm2培養(yǎng)面積(6 孔板單孔或 35 mm 平皿)加入 1 mL Trizol,用加樣器吹打數(shù)次,以確保細(xì)胞裂解,然后轉(zhuǎn)移至離心管中。 注:Trizol 的使用量應(yīng)由培養(yǎng)皿表面 積決定,而非由細(xì)胞數(shù)目決定。Trizol 量不足可能導(dǎo)致提取的 RNA 中有 DNA 污染 。 (2)懸浮細(xì)胞:離心收集細(xì)胞,吸盡液體,每 5-10×106動(dòng)植物或酵母細(xì)胞,或每 1×107細(xì)菌細(xì)胞加入 1mL Trizol, 用加樣器吹打,使其裂解,然后轉(zhuǎn)移至離心管中。 注:添加 Trizol 前切勿洗滌細(xì)胞 ,以免 RNA 降解。必要時(shí)可以用勻漿器來(lái)裂解某些細(xì)菌或者酵母細(xì)胞 。
2、液相分離:
(1)裂解產(chǎn)物于室溫放置 5 min,使核酸-蛋白復(fù)合物分離。(注:此時(shí)樣品可在-80℃長(zhǎng)期保存。 ) (2)每 1 mL Trizol 加入 0.2 mL 氯仿,蓋緊管蓋,劇烈振蕩 15 s,室溫放置 2-3 min。 (3)4℃ 12,000 x g 離心 15 min,樣品會(huì)分成三層:桔黃色的下層有機(jī)相,中間層和無(wú)色的上層水相。 (4)吸取含總 RNA 的上層水相至一新的離心管中,吸取水相的體積為所用 Trizol 試劑的 60%。
3、RNA 回收
(1)按照每 1 mL Trizol 的最初使用量加入 0.5 mL 異丙醇,顛倒數(shù)次混勻,室溫放置 10 min。 (2) 4℃ 12,000 x g 離心 10 min,棄除上清,可見(jiàn)膠狀的 RNA 沉淀。 (3)按照每 1 mL Trizol 的最初使用量加入 1 mL 75%乙醇,顛倒數(shù)次混勻,洗滌沉淀。 (4)4℃ 12,000 x g 離心 5 min,棄除上清。 (5)室溫倒置 5-10 min 晾干或真空抽干(不要使用真空干燥離心機(jī),以免 RNA 過(guò)干,難以溶解)。 (6)加入適量(如 25uL) DEPC-ddH2O 或 TE 緩沖液,用加樣器吹打數(shù)次溶解 RNA。 (7)通過(guò) RNA 電泳以及紫外分光光度計(jì)檢測(cè),確定 RNA 的濃度、純度和完整性。 (8)所得的 RNA 應(yīng)立即使用或適量分裝后-80℃保存,避免反復(fù)凍融。
產(chǎn)品推薦:
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 規(guī)格 | abs60154 | Trizol | 100mL/500mL | abs9331 | Trizol(總RNA抽提試劑盒) | 1kit | abs9259 | 無(wú)酶無(wú)菌水 | 500mL |
二、逆轉(zhuǎn)錄 1、去除RNA中基因組DNA殘留:
組分 | 體積 | RNA模板* | ≤ 1 ug total RNA 或≤ 0.1 ug poly(A) mRNA | 5×gDNA remover buffer | 2 uL | gDNA remover | 1 uL | Nuclease-free Water (DEPC-treated) | 補(bǔ)足至10 uL |
混勻,并短暫離心,反應(yīng)條件為37℃,5 min。 * 采用自備的序列特異性引物時(shí),RNA 模板的量可調(diào)整為“≤ 5 ug total RNA 或≤ 0.5 ug poly(A) mRNA"
2、在上述的反應(yīng)管中,直接添加如下的反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)所需組分,進(jìn)行第一鏈cDNA 的合成步驟:
組分 | 體積 | gDNA remover 處理后RNA 樣品 | 10 uL | 5 x Buffer (with primer) | 4 uL | Enzyme mix | 1 uL | Nuclease-free Water (DEPC-treated) | 補(bǔ)足至20 uL |
3、輕輕混勻,短暫離心;42℃孵育15-50 min。注意:復(fù)雜模板逆轉(zhuǎn)錄溫度可升高至50℃,提高反轉(zhuǎn)錄效率。 反應(yīng)時(shí)間可根據(jù)實(shí)驗(yàn)應(yīng)用場(chǎng)景做適當(dāng)調(diào)整。如合成的cDNA 用作qPCR 模板,則反應(yīng)條件為42℃孵育15 min。
4、85℃加熱5 min 失活Enzyme mix。
5、反應(yīng)結(jié)束后所得的cDNA,請(qǐng)置于冰上進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)或冷凍保存。
產(chǎn)品推薦:
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 規(guī)格 | abs601510 | First-strand cDNA Synthesis Mix With gDNA Remover | 50T/100T/200T |
三、qPCR實(shí)驗(yàn) 染料法qPCR (以abs601511產(chǎn)品為例)
用戶(hù)需自備的試劑:cDNA 或 DNA 模板、引物、ROX Reference Dye/ROX Reference Dye II。
請(qǐng)按照不同品牌熒光定量PCR儀的使用說(shuō)明書(shū)要求進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作。
操作示例:分別以20 µ l和50 µ l PCR反應(yīng)體系為例:
1、PCR 反應(yīng)體系的建立:
組分 | 20uL體系 | 50uL體系 | DNA模板 | 1uL | 1uL | 正向引物(10uM) | 0.5uL | 1uL | 反向引物(10uM) | 0.5uL | 1uL | 2×RealStar Green Fast Mixture | 10uL | 25uL | ROX Reference Dye/ROX Reference Dye II | 0.4uL | 1uL | RNase-free H2O | 補(bǔ)足至20uL | 補(bǔ)足至50uL |
注: *模板量: 10-100 ng基因組DNA,或 1-10 ng cDNA 為參照,因不同物種的模板中含有的目的基因拷貝數(shù)不同,可對(duì)模板進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)源_定最佳的模板使用量。 另外, Two Step RT-PCR 反應(yīng)的cDNA( RT 反應(yīng)液)作為模板時(shí)的添加量不要超過(guò) PCR 反應(yīng)液總體積的10% 。 *引物:通常引物濃度以 0.2 μM 可以得到較好結(jié)果,可以終濃度 0.1-1.0 μM 作為設(shè)定范圍的參考。擴(kuò)增效率不高的情況下,可提高引物的濃度;發(fā)生非特異性反應(yīng)時(shí),可降低引物濃度,由此優(yōu)化反應(yīng)體系。為了獲得理想的 qPCR 的效果,擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度建議為 80-200 bp 。 *不同儀器所需 ROX Reference Dye不同,或需要添加或不需要添加,請(qǐng)根據(jù)儀器說(shuō)明進(jìn)行操作。
2、PCR 反應(yīng)條件的設(shè)置: 本制品中使用的HotStart Taq DNA Polymerase是利用抗Taq抗體封閉的HotStart DNA聚合酶,如果在PCR反應(yīng) 前進(jìn)行模板的預(yù)變性,通常設(shè)定為95℃、2 min,復(fù)雜或高GC模板適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間至5 min。該DNA聚合酶在15 s內(nèi)可完成至 少300 bp的擴(kuò)增,可以滿(mǎn)足絕大多數(shù)的qPCR實(shí)驗(yàn);對(duì)于超過(guò)350 bp或者高GC含量的擴(kuò)增子,建議增加延伸時(shí)間至60 s或者采用三步法以提高擴(kuò)增效率。
兩步法 PCR 擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)程序: | 預(yù)變性 | 95℃ | 2min | 40 Cycles | 變性 | 95℃ | 15s | 退火/延伸 | 60℃ | 15-30s | 溶解曲線(xiàn)(儀器自動(dòng)設(shè)置) |
三步法 PCR 擴(kuò)增程序: | 預(yù)變性 | 95℃ | 2min | 40 Cycles | 變性 | 95℃ | 15s | 退火 | 60℃ | 15-30s | 延伸 | 72℃ | 30s | 溶解曲線(xiàn)(儀器自動(dòng)設(shè)置) |
注 : 以上舉例為常規(guī) qPCR反應(yīng)系統(tǒng),僅供參考。實(shí)際反應(yīng)條件因模板、引物等的結(jié)構(gòu)不同而各異 , 需根據(jù)模板、引物、目的片段的特點(diǎn)設(shè)定最佳反應(yīng)條件,并根據(jù)比例放大或縮小反應(yīng)體系。
3、在相應(yīng)的 Real Time PCR 儀器上完成實(shí)驗(yàn),并分析結(jié)果。
產(chǎn)品推薦:
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 規(guī)格 | 應(yīng)用 | abs601511 | 2×預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系 | 1.7mL×3 | 染料法qPCR | abs601512 | 2×預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系(高濃度ROX) | 1.7mL×3 | 染料法qPCR | abs601513 | 2×預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系(低濃度ROX) | 1.7mL×3 | 染料法qPCR | abs60305 | 探針?lè)晒舛縋CR試劑盒 | 100T/200T/500T | 探針?lè)╭PCR | abs60307 | 探針?lè)ǔ?jí)多重?zé)晒舛縋CR試劑盒 | 100T/200T/500T | 探針?lè)╭PCR |
耗材產(chǎn)品推薦:
貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 規(guī)格 | abs7089 | 0.1mL PCR反應(yīng)板(透明,半裙邊) | 1箱 | abs7090 | 0.1mL PCR反應(yīng)板(透明,無(wú)裙邊) | 1箱 | abs7091 | 0.2mL PCR反應(yīng)板(透明,半裙邊) | 1箱 | abs7092 | 0.2mL PCR反應(yīng)板(透明,無(wú)裙邊) | 1箱 | abs7246 | 熒光定量PCR封板膜(壓敏強(qiáng)粘) | 1盒 | abs7247 | 熒光定量PCR封板膜(24/48孔,壓敏) | 1盒 | abs7248 | PCR封板膜(強(qiáng)粘高透) | 1盒 | abs7093 | 100uL PCR 8連管(帶蓋) | 1箱 | abs7094 | 200uL PCR 8連管(帶蓋) | 1箱 | abs7119 | 1.5mL離心管(無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7118 | 0.5mL離心管(無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7071 | 10uL濾芯吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7074 | 200uL濾芯吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7077 | 1000uL濾芯吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7176 | 20uL濾芯吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7072 | 10uL吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7073 | 10uL吸頭(袋裝 無(wú)酶) | 1箱 | abs7075 | 200uL吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7076 | 200uL吸頭(袋裝 無(wú)酶) | 1箱 | abs7078 | 1000uL加長(zhǎng)吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7079 | 1000uL吸頭(盒裝 無(wú)菌無(wú)酶) | 1箱 | abs7080 | 1000uL吸頭(袋裝 無(wú)酶) | 1箱 | abs7081 | 1000uL加長(zhǎng)吸頭(袋裝 無(wú)酶) | 1箱 |
Absin文獻(xiàn)獎(jiǎng)勵(lì)重磅升級(jí)!
 Absin產(chǎn)品線(xiàn):
爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測(cè)、殘留檢測(cè)、多因子檢測(cè));細(xì)胞培養(yǎng)(類(lèi)器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))... 特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL... 愛(ài)必信(上海)生物科技有限公司 微信公眾號(hào):愛(ài)必信生物 | 必信二維碼(2).jpg) |
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