目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學(xué)試劑>>試劑盒>> DNA 5’末端磷酸化試劑盒
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 20次 |
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貨號 | XY-D-1884 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | DNA 5’ End Phosphorylation Kit |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 1年 |
產(chǎn)品簡介:
本產(chǎn)品為 DNA 5’末端標(biāo)記系統(tǒng),利用 T4 Polynucleotide Kinase(T4 多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP 對粘性末端或平末端的 DNA 或 RNA 的 5’末端進(jìn)行高效標(biāo)記反應(yīng)。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1.使用本試劑盒之前,不需要對 5’末端的磷酸基團(tuán)進(jìn)行去磷酸化處理,因為使用的kinase 能使 5’末端的磷酸與[γ-32P]ATP 的γ-磷酸進(jìn)行交換。
2.合成的單鏈或雙寡核苷酸的 5’末端游離的 OH 基團(tuán)都能通過 Kinase 反應(yīng)被標(biāo)記
(或者只是簡單的磷酸化)。
3.提供的兩種反應(yīng)液使交換反應(yīng)和磷酸化反應(yīng)都能高效進(jìn)行, 均能得到大于106cpm/pmol(5’﹣end)的比活性。
4.快速,最快 25 分鐘即可完成標(biāo)記反應(yīng)。
5.本產(chǎn)品足夠 20 次 20?L 體系的填入法標(biāo)記實(shí)驗。
6.DNA 5’末端磷酸化試劑盒只能用于科研。
產(chǎn)品參數(shù):
成份規(guī)格包裝
T4 多聚核苷酸激酶
(10 U/μL)20 ?L0.5mL 綠蓋管
5×交換反應(yīng)緩沖液100 ?L0.5mL 紅蓋管
10×磷酸緩沖液50 ?L0.5mL 黃蓋管
Control DNA20 ?L0.5mL 藍(lán)蓋管
使用手冊1 份無
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑
DNA 片段、[γ-32P]ATP 或其它的標(biāo)記、未標(biāo)記的 ATPs、牛小腸堿性磷酸。
使用方法:
一、交換反應(yīng)
1.實(shí)驗前需自備的試劑:7M 醋酸銨、100%乙醇、70%乙醇等
2.在微量離心管中制備下列反應(yīng)液:
注:5 pmoles 的 5’末端約等于 0.17μg 的長 100bp 的雙鏈 DNA。
3.37℃反應(yīng) 30 分鐘。
4.70℃加熱 5-10 分鐘使酶失活。
5.加入 10μL 的 7M CH3COONH4(pH 4.5)。如使用 CH3COONa 做乙醇沉淀時使其終濃度達(dá) 300mM。
6. 加入 87.5μL(2.5 倍)的冷無水乙醇,-20℃放置 30-60 分鐘。
7.離心回收沉淀,用 70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
8.用適當(dāng) Buffer 溶解沉淀。
注:通過第 5-8 步操作幾乎可以除去大部分未反應(yīng)的[γ-32P] ATP,如要完-全其除去時,乙醇沉淀后用凝膠過濾等方法精制即可。如需用苯-酚抽提除去蛋白質(zhì)時, 請在第 8 步之后進(jìn)行。
二、磷酸化反應(yīng)標(biāo)記
A.去磷酸化反應(yīng)
9.實(shí)驗前需自備的試劑:TE 飽和酚/氯仿、3M NaCl、100%乙醇、70%乙醇、牛小腸堿性磷酸酶(CIAP)等。
10.在微量離心管中制備下列反應(yīng)液:
成分用量
自備的 DNA 片段133 μL(≤10 μg)
1 M Tris-HCl,pH 8.015 μL
牛小腸堿性磷酸酶
(CIAP,10~20 U/μL)2 ?L
滅菌的超純水補(bǔ)水至 150 ?L
總體積150 μL
11.50℃反應(yīng) 30 分鐘。
12.加入 150 μL 的 TE 飽和酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),充分混勻。
13.離心,取上層(水層)移到另一個微量離心管中。
14.重復(fù)操作 12-13。15.
16. 加入 7.5μL 的 3M NaCl(最終濃度 150mM)。
17. 加入 375μL(2.5 倍量)的冷無水乙醇,-20℃放置 30-60 分鐘。
18.離心回收沉淀,用 1mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
19.使用 20μL 的 TE Buffer 溶解沉淀。 B.磷酸化反應(yīng)(前反應(yīng))
20.在微量離心管中制備下列反應(yīng)液:
21.37℃反應(yīng) 30 分鐘。
22.下面的操作與交換反應(yīng)的第 4-8 步操作相同。
三、合成 DNA 寡核苷酸的標(biāo)記
23.在微量離心管中制備下列反應(yīng)液:
24.37℃反應(yīng) 30 分鐘。
25.下面的操作與交換反應(yīng)的第 4-8 步操作相同。
26.當(dāng)摻入水平很低的時候,需要使用本步驟,即通過體積排阻色譜或過濾試劑盒除去未反應(yīng)的標(biāo)記。Sephadex G﹣50 層析柱(需另購)對于去除未摻入的 dNTPs 效果很好,它還能大幅減少小于 20 個堿基的DNA 寡核苷酸和小于 20bp 的雙鏈DNA 的量。使用之前需要在70℃加熱5-10 分鐘以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 層析柱可以用來純化長度不小于 10 個堿基的寡核苷酸。
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