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Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit的應(yīng)用案例

來源:上海易匯生物科技有限公司   2025年05月06日 14:06  

(一)病毒研究領(lǐng)域

在對新冠病毒的研究中,科研人員需要從臨床樣本(如咽拭子、痰液樣本經(jīng)處理后提取的 RNA)中獲取高質(zhì)量的病毒 RNA 進(jìn)行基因測序、病毒載量分析等實(shí)驗(yàn)。使用該試劑盒對提取的 RNA 進(jìn)行質(zhì)量評估,通過 RNA IQ 值能快速判斷 RNA 是否完整,是否存在降解情況。若 RNA 質(zhì)量不佳,后續(xù)的測序結(jié)果可能出現(xiàn)序列缺失、錯(cuò)誤等問題,影響對病毒變異情況的準(zhǔn)確判斷。如某研究團(tuán)隊(duì)在對不同地區(qū)新冠病毒株的 RNA 分析中,利用該試劑盒篩選出高質(zhì)量 RNA 樣本,成功完成病毒全基因組測序,為追蹤病毒傳播路徑及變異規(guī)律提供了可靠數(shù)據(jù)。
(二)癌癥研究方面
在腫瘤細(xì)胞 RNA 提取實(shí)驗(yàn)中,如研究乳腺癌細(xì)胞的基因表達(dá)譜,需從培養(yǎng)的乳腺癌細(xì)胞或手術(shù)切除的腫瘤組織中提取 RNA。該試劑盒可精準(zhǔn)測定 RNA 濃度及完整性,為后續(xù)的基因芯片分析、RNA 測序(RNA-Seq)實(shí)驗(yàn)提供保障。在 RNA-Seq 實(shí)驗(yàn)中,高質(zhì)量完整的 RNA 能保證測序文庫構(gòu)建的成功率和準(zhǔn)確性,從而全面準(zhǔn)確地檢測腫瘤細(xì)胞中差異表達(dá)的基因,助力揭示癌癥發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制。例如,通過對大量乳腺癌樣本 RNA 質(zhì)量評估及后續(xù)分析,發(fā)現(xiàn)了與乳腺癌轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的關(guān)鍵基因,為乳腺癌治療靶點(diǎn)的篩選提供了新方向。
(三)神經(jīng)科學(xué)研究領(lǐng)域
在對神經(jīng)元 RNA 的研究中,由于神經(jīng)元細(xì)胞獲取困難,RNA 產(chǎn)量低且易降解,所以對 RNA 質(zhì)量檢測方法的靈敏度要求。Qubit RNA IQ Assay Kit 憑借其高靈敏度,僅需極少量樣本,就能對從神經(jīng)元細(xì)胞中提取的 RNA 進(jìn)行有效檢測。在研究神經(jīng)退行性疾?。ㄈ绨柎暮D。┑陌l(fā)病機(jī)制時(shí),需分析患者神經(jīng)元細(xì)胞中特定 RNA 的變化情況。該試劑盒可準(zhǔn)確評估 RNA 質(zhì)量,確保后續(xù)針對這些 RNA 的功能研究(如逆轉(zhuǎn)錄 PCR 檢測基因表達(dá)量、RNA 干擾實(shí)驗(yàn)等)結(jié)果可靠。通過對阿爾茨海默病患者神經(jīng)元 RNA 分析,發(fā)現(xiàn)了一些與疾病進(jìn)程相關(guān)的異常表達(dá)的非編碼 RNA,為理解疾病發(fā)病機(jī)制提供了新線索。
(四)植物科學(xué)研究方面
在植物抗逆性研究中,科研人員會(huì)研究植物在干旱、高溫等逆境脅迫下的基因表達(dá)變化。從受脅迫處理的植物葉片、根系等組織中提取 RNA 后,利用該試劑盒評估 RNA 質(zhì)量。例如,在研究小麥對干旱脅迫的響應(yīng)機(jī)制時(shí),通過測定不同干旱程度下小麥葉片 RNA 的 IQ 值,結(jié)合后續(xù)的轉(zhuǎn)錄組分析,找到了一系列參與小麥抗旱反應(yīng)的關(guān)鍵基因,為培育抗旱小麥品種提供了理論基礎(chǔ)。同時(shí),在植物基因工程實(shí)驗(yàn)中,對導(dǎo)入外源基因的植物細(xì)胞或轉(zhuǎn)基因植物后代進(jìn)行 RNA 質(zhì)量檢測,可確保外源基因在植物體內(nèi)正常轉(zhuǎn)錄表達(dá),推動(dòng)植物基因工程研究進(jìn)展。
(五)環(huán)境微生物分析領(lǐng)域
在海洋微生物群落研究中,從海水中過濾收集微生物,提取其總 RNA。由于環(huán)境樣本復(fù)雜,微生物種類繁多,RNA 易受多種因素影響而降解。該試劑盒可快速判斷 RNA 質(zhì)量,為后續(xù)分析海洋微生物群落結(jié)構(gòu)、功能基因表達(dá)等實(shí)驗(yàn)奠定基礎(chǔ)。通過對不同海域微生物 RNA 質(zhì)量評估及高通量測序分析,發(fā)現(xiàn)了在不同海洋生態(tài)環(huán)境下,微生物群落中參與碳循環(huán)、氮循環(huán)等關(guān)鍵代謝途徑的基因表達(dá)差異,有助于深入了解海洋生態(tài)系統(tǒng)的物質(zhì)循環(huán)和能量流動(dòng)。同樣,在土壤微生物研究中,對從土壤樣本中提取的 RNA 進(jìn)行質(zhì)量檢測,能幫助科研人員篩選出適用于分析土壤微生物多樣性和功能的高質(zhì)量 RNA 樣本,進(jìn)而研究土壤微生物在土壤肥力保持、污染物降解等方面的作用機(jī)制 。



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