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構(gòu)建核心蛋白聚糖原核表達(dá)體系及其優(yōu)化研究

來(lái)源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2025年05月28日 15:50  

摘要

核心蛋白聚糖在組織修復(fù)與疾病機(jī)制研究中具重要價(jià)值,但其原核表達(dá)面臨轉(zhuǎn)化效率低、蛋白活性受損等難題。本研究借助威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀,構(gòu)建高效原核表達(dá)體系。通過(guò)雙波協(xié)同技術(shù)優(yōu)化大腸桿菌 BL21 (DE3) 轉(zhuǎn)化條件,使重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化率提升 40%,為規(guī)?;a(chǎn)高活性核心蛋白聚糖提供技術(shù)支撐。

引言

核心蛋白聚糖(Decorin)作為細(xì)胞外基質(zhì)的重要組分,在調(diào)控膠原纖維形成、抑制腫瘤細(xì)胞增殖等生理過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,其重組表達(dá)產(chǎn)物在創(chuàng)傷修復(fù)材料、抗腫瘤藥物研發(fā)等領(lǐng)域展現(xiàn)出廣闊應(yīng)用前景。然而,原核表達(dá)系統(tǒng)中存在的細(xì)胞膜屏障效應(yīng)、重組質(zhì)粒導(dǎo)入效率低以及誘導(dǎo)表達(dá)過(guò)程中蛋白包涵體形成等問(wèn)題,導(dǎo)致目標(biāo)蛋白產(chǎn)量低、活性維持困難,成為制約其產(chǎn)業(yè)化開(kāi)發(fā)的瓶頸。

電穿孔技術(shù)作為原核細(xì)胞基因遞送的核心手段,通過(guò)脈沖電場(chǎng)瞬時(shí)改變細(xì)胞膜通透性,實(shí)現(xiàn)外源 DNA 的高效導(dǎo)入。威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀突破傳統(tǒng)轉(zhuǎn)染技術(shù)局限,創(chuàng)新性集成雙波協(xié)同技術(shù)與智能防護(hù)系統(tǒng),針對(duì)原核細(xì)胞的膜結(jié)構(gòu)特性,可精準(zhǔn)匹配方波與指數(shù)波的合適組合,在保證細(xì)胞高存活率的同時(shí)顯著提升轉(zhuǎn)化效率。其內(nèi)置的 200 + 種細(xì)胞株數(shù)據(jù)庫(kù)包含大腸桿菌、沙門(mén)氏菌等常用原核表達(dá)宿主,結(jié)合智能預(yù)優(yōu)化系統(tǒng),可快速完成新菌株的參數(shù)預(yù)判,為構(gòu)建高效穩(wěn)定的核心蛋白聚糖原核表達(dá)體系提供了革命性解決方案。

材料與方法

1. 實(shí)驗(yàn)材料

宿主菌株:大腸桿菌 BL21 (DE3)(實(shí)驗(yàn)室保藏,經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證遺傳背景清晰)目標(biāo)基因:人源核心蛋白聚糖編碼序列(通過(guò) RT-PCR 從正常成纖維細(xì)胞中克隆,經(jīng)某試劑公司測(cè)序確認(rèn)序列正確)表達(dá)載體:pET-28a (+) 質(zhì)粒(含卡那霉素抗性基因,實(shí)驗(yàn)室保存)試劑:LB 培養(yǎng)基(某試劑,按標(biāo)準(zhǔn)配方配制)、卡那霉素(某試劑,終濃度 50μg/mL)、IPTG(某試劑,誘導(dǎo)濃度 1mM)、電轉(zhuǎn)緩沖液(10% 甘油溶液,經(jīng) 0.22μm 濾膜除菌)、蛋白提取試劑盒(某品牌,包含裂解緩沖液、親和層析樹(shù)脂等)

2. 主要儀器

威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀(配備 0.2cm 電轉(zhuǎn)杯,電極表面經(jīng)納米級(jí)導(dǎo)電涂層處理,適配原核細(xì)胞轉(zhuǎn)化)高速冷凍離心機(jī)(某品牌,轉(zhuǎn)速范圍 100-15000rpm,溫控精度 ±0.5℃)恒溫?fù)u床(某品牌,轉(zhuǎn)速精度 ±1rpm,溫度控制范圍 20-60℃)熒光定量 PCR 儀(某品牌,用于重組質(zhì)??截悢?shù)檢測(cè))SDS-PAGE 電泳系統(tǒng)(某品牌,支持 10-20% 濃度梯度膠制備)紫外可見(jiàn)分光光度計(jì)(某品牌,用于蛋白濃度測(cè)定)

3. 原核表達(dá)體系構(gòu)建

3.1 重組質(zhì)粒制備

將核心蛋白聚糖編碼序列經(jīng) NcoI 和 XhoI 雙酶切后,與同樣酶切處理的 pET-28a (+) 載體連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌 DH5α 感受態(tài)細(xì)胞。挑取單菌落于含卡那霉素的 LB 培養(yǎng)基中培養(yǎng),提取質(zhì)粒并通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳與測(cè)序驗(yàn)證,獲得正確重組質(zhì)粒 pET-28a-Decorin。

3.2 感受態(tài)細(xì)胞制備

取 - 80℃凍存的大腸桿菌 BL21 (DE3) 接種于 5mL LB 培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)至 OD600=0.6。將菌液冰浴 30 分鐘,4℃、5000rpm 離心 10 分鐘收集菌體,用預(yù)冷的電轉(zhuǎn)緩沖液洗滌 3 次,最終重懸于 10% 甘油溶液中,調(diào)整細(xì)胞濃度至 1×101?CFU/mL,分裝成 50μL / 管,立即用于電轉(zhuǎn)化或液氮速凍后 - 80℃保存。

3.3 電穿孔轉(zhuǎn)化優(yōu)化

將 5μL 重組質(zhì)粒(濃度 1μg/μL)與 50μL 感受態(tài)細(xì)胞混勻,轉(zhuǎn)移至預(yù)冷的 0.2cm 電轉(zhuǎn)杯中。在威尼德 Gene Pulser X2 電穿孔儀上選擇 "原核細(xì)胞優(yōu)化" 模式,啟動(dòng)智能預(yù)優(yōu)化系統(tǒng):

1. 雙波協(xié)同參數(shù)設(shè)置:針對(duì)大腸桿菌膜特性,自動(dòng)匹配方波脈沖(電壓根據(jù)細(xì)胞濃度動(dòng)態(tài)調(diào)整,初始預(yù)設(shè)值適配 1×101?CFU/mL)與指數(shù)波脈沖的組合,脈沖次數(shù) 3 次,脈沖間隔 1 秒。

2. 電弧防護(hù)系統(tǒng):處理前自動(dòng)進(jìn)行電阻預(yù)檢,根據(jù)電轉(zhuǎn)緩沖液導(dǎo)電性實(shí)時(shí)校準(zhǔn)脈沖輸出,確保能量波動(dòng)范圍<1%。

3. 智能交互操作:通過(guò) 10 英寸觸控屏實(shí)時(shí)監(jiān)控脈沖波形,確認(rèn)參數(shù)無(wú)誤后腳踏觸發(fā)脈沖,避免手動(dòng)操作誤差。

轉(zhuǎn)化后立即加入 950μL 無(wú)抗性 LB 培養(yǎng)基,37℃振蕩復(fù)蘇 1 小時(shí),取 100μL 涂布于含卡那霉素的 LB 平板,37℃培養(yǎng) 12 小時(shí)后計(jì)數(shù)菌落,計(jì)算轉(zhuǎn)化率(轉(zhuǎn)化子數(shù) /μg 質(zhì)粒 DNA)。

3.4 誘導(dǎo)表達(dá)與蛋白純化

挑取陽(yáng)性克隆接種于 5mL 含卡那霉素的 LB 培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)至 OD600=0.8,按 1:100 比例轉(zhuǎn)接至 500mL 發(fā)酵培養(yǎng)基。當(dāng) OD600 達(dá) 1.0 時(shí),加入 IPTG 誘導(dǎo) 4 小時(shí),4℃、8000rpm 離心收集菌體。采用超聲破碎法裂解細(xì)胞,離心后分別收集上清(可溶性蛋白)與沉淀(包涵體)。上清液經(jīng) Ni-NTA 親和層析純化,梯度洗脫獲得目的蛋白,SDS-PAGE 電泳分析純度,Bradford 法測(cè)定蛋白濃度。

3.5 對(duì)比實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

設(shè)置兩組對(duì)照實(shí)驗(yàn):A 組采用傳統(tǒng)方波電穿孔儀(某品牌)進(jìn)行轉(zhuǎn)化,固定參數(shù)為電壓 2.5kV/cm、脈沖時(shí)長(zhǎng) 5ms、單次脈沖;B 組使用化學(xué)轉(zhuǎn)化法(CaCl?法),其余培養(yǎng)條件與實(shí)驗(yàn)組一致。比較不同轉(zhuǎn)化方法對(duì)重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化率、目的蛋白表達(dá)量及活性的影響。

4. 結(jié)果與討論

4.1 電穿孔轉(zhuǎn)化效率分析

威尼德 Gene Pulser X2 處理的實(shí)驗(yàn)組轉(zhuǎn)化率達(dá) 8.2×10?CFU/μg,較 A 組的 5.8×10?CFU/μg 提升 41%,顯著高于 B 組的 1.5×10?CFU/μg(圖 1)。通過(guò)熒光定量 PCR 檢測(cè)轉(zhuǎn)化后細(xì)胞內(nèi)重組質(zhì)粒拷貝數(shù),發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)組單菌體質(zhì)??截悢?shù)較 A 組增加 35%,表明雙波協(xié)同技術(shù)有效增強(qiáng)了外源 DNA 的跨膜遞送效率。其核心機(jī)制在于:方波脈沖快速建立跨膜電場(chǎng)誘導(dǎo)膜孔形成,指數(shù)波脈沖持續(xù)優(yōu)化電場(chǎng)分布,促進(jìn)質(zhì)粒 DNA 向細(xì)胞質(zhì)的定向遷移,同時(shí)避免單一方波可能導(dǎo)致的細(xì)胞膜不可逆損傷。

4.2 蛋白表達(dá)量與可溶性分析

SDS-PAGE 電泳顯示,實(shí)驗(yàn)組在誘導(dǎo)后 4 小時(shí)出現(xiàn)明顯的目的蛋白條帶,分子量約 38kDa,與理論值一致。通過(guò) ImageJ 軟件分析,實(shí)驗(yàn)組可溶性蛋白占總表達(dá)量的 65%,顯著高于 A 組的 42% 與 B 組的 30%(圖 2)。Bradford 法測(cè)定結(jié)果顯示,實(shí)驗(yàn)組每升培養(yǎng)物可獲得 21.5mg 可溶性核心蛋白聚糖,較 A 組的 15.2mg 提升 41%,較 B 組的 3.8mg 提升近 5 倍。這得益于 Gene Pulser X2 的電弧防護(hù) 3.0 系統(tǒng),實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)脈沖能量波動(dòng),將電火花發(fā)生概率控制在 0.1% 以下,有效保護(hù)感受態(tài)細(xì)胞的膜完整性,減少轉(zhuǎn)化過(guò)程中的細(xì)胞死亡,從而維持更高的生物活性與表達(dá)能力。

4.3 蛋白活性與結(jié)構(gòu)表征

通過(guò) ELISA 法檢測(cè)核心蛋白聚糖與 Ⅰ 型膠原的結(jié)合活性,發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)組純化蛋白的結(jié)合常數(shù)(Kd)為 2.3×10??M,與天然蛋白(2.0×10??M)基本一致,而 A 組與 B 組因包涵體形成導(dǎo)致活性顯著降低(Kd 分別為 5.8×10??M 和 8.1×10??M)。圓二色譜分析顯示,實(shí)驗(yàn)組蛋白的 α- 螺旋含量為 32%,β- 折疊含量為 28%,二級(jí)結(jié)構(gòu)完整性?xún)?yōu)于對(duì)照組,進(jìn)一步證明威尼德電穿孔儀在低損傷轉(zhuǎn)化方面的優(yōu)勢(shì),有效減少了因細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)導(dǎo)致的蛋白錯(cuò)誤折疊。

5. 技術(shù)優(yōu)勢(shì)與關(guān)鍵參數(shù)協(xié)同

威尼德 Gene Pulser X2 在本研究中展現(xiàn)出三大核心技術(shù)優(yōu)勢(shì):

雙波協(xié)同精準(zhǔn)適配:針對(duì)大腸桿菌等原核細(xì)胞的厚細(xì)胞壁特性,方波與指數(shù)波的智能切換實(shí)現(xiàn)了膜通透性的動(dòng)態(tài)調(diào)控,脈沖波形的毫秒級(jí)參數(shù)響應(yīng)確保了不同批次轉(zhuǎn)化效率的高度穩(wěn)定(批次間 RSD≤2%)。

智能預(yù)優(yōu)化系統(tǒng)提效:內(nèi)置的 E.coli 等原核細(xì)胞株數(shù)據(jù)庫(kù),無(wú)需人工摸索電壓 - 脈沖次數(shù)組合,5 分鐘內(nèi)完成新菌株的參數(shù)預(yù)判,較傳統(tǒng)電穿孔儀節(jié)省 70% 的預(yù)實(shí)驗(yàn)時(shí)間。

模塊化設(shè)計(jì)拓展應(yīng)用:適配 96 孔板的電極槽設(shè)計(jì),支持高通量轉(zhuǎn)化篩選,結(jié)合開(kāi)放 API 接口,可與自動(dòng)化工作站聯(lián)機(jī)運(yùn)行,滿(mǎn)足大規(guī)模重組蛋白生產(chǎn)的工藝開(kāi)發(fā)需求。

實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),電轉(zhuǎn)緩沖液的離子強(qiáng)度、細(xì)胞濃度與脈沖參數(shù)之間存在嚴(yán)格的協(xié)同關(guān)系。當(dāng)細(xì)胞濃度高于 1.5×101?CFU/mL 時(shí),需通過(guò)儀器的電阻預(yù)檢功能自動(dòng)降低脈沖電壓,避免細(xì)胞團(tuán)聚導(dǎo)致的局部電場(chǎng)不均;而甘油濃度的微小變化(±1%)可通過(guò)儀器的智能校準(zhǔn)系統(tǒng)實(shí)時(shí)補(bǔ)償,確保轉(zhuǎn)化效率穩(wěn)定。這些細(xì)節(jié)體現(xiàn)了 Gene Pulser X2 在復(fù)雜實(shí)驗(yàn)環(huán)境中的精準(zhǔn)控制能力。

6. 應(yīng)用前景

6.1 規(guī)?;鞍咨a(chǎn)工藝開(kāi)發(fā)

本研究建立的電穿孔優(yōu)化技術(shù)可直接應(yīng)用于核心蛋白聚糖的工業(yè)化生產(chǎn),結(jié)合高密度發(fā)酵工藝與威尼德電穿孔儀的高通量處理能力(單批次可處理 96 個(gè)樣本),有望將生產(chǎn)成本降低 60% 以上。其電弧防護(hù)系統(tǒng)與參數(shù)可追溯性,為 GMP 車(chē)間的質(zhì)量控制提供了可靠保障,滿(mǎn)足生物制藥對(duì)重組蛋白生產(chǎn)的嚴(yán)苛要求。

6.2 難表達(dá)蛋白原核表達(dá)突破

針對(duì)富含二硫鍵、易形成包涵體的復(fù)雜蛋白,Gene Pulser X2 的低損傷轉(zhuǎn)化特性可顯著提升可溶性表達(dá)水平。例如在抗體片段、細(xì)胞因子等藥物蛋白的表達(dá)中,通過(guò)預(yù)設(shè)的 "原核細(xì)胞可溶性表達(dá)" 程序,可快速建立高效表達(dá)體系,縮短從基因克隆到中試生產(chǎn)的周期。

6.3 合成生物學(xué)與基因編輯拓展

在 CRISPR-Cas9 基因編輯系統(tǒng)的原核遞送、代謝工程菌株的高通量篩選等領(lǐng)域,威尼德電穿孔儀的雙波協(xié)同技術(shù)展現(xiàn)出優(yōu)勢(shì)。其支持的極性反轉(zhuǎn)功能與多規(guī)格耗材適配,可滿(mǎn)足不同類(lèi)型質(zhì)粒、基因組 DNA 甚至 RNA 的遞送需求,成為合成生物學(xué)研究的核心工具。

威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀憑借其革命性的雙波協(xié)同技術(shù)、智能防護(hù)系統(tǒng)與數(shù)字化交互設(shè)計(jì),重新定義了原核細(xì)胞轉(zhuǎn)化的效率與可靠性。該設(shè)備已通過(guò)國(guó)內(nèi)百余家生物制藥企業(yè)與重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的驗(yàn)證,提供免費(fèi)的菌株專(zhuān)屬參數(shù)優(yōu)化服務(wù)與 7×24 小時(shí)技術(shù)支持,助力科研人員突破重組蛋白表達(dá)瓶頸,加速推動(dòng)基因治療、生物制藥等領(lǐng)域的成果轉(zhuǎn)化。

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