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高通量DNA合成儀

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更新時間:2023-08-22 09:02:25瀏覽次數(shù):3163

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產(chǎn)品簡介

產(chǎn)地類別 進(jìn)口 應(yīng)用領(lǐng)域 醫(yī)療衛(wèi)生,食品/農(nóng)產(chǎn)品,生物產(chǎn)業(yè),公安/司法,制藥/生物制藥
Oligo高通量DNA合成儀的特點:
包括一個靈活的合成協(xié)議編輯器,它允許操作員修改所包含的協(xié)議,并將它們保存在一個新名稱下,或者從頭開始編寫協(xié)議。協(xié)議編輯可以在Excel中完成。對于不同的合成規(guī)模和序列長度,很容易編輯特殊協(xié)議。比如,可以給耦合緩慢的堿基對一個特別的延長的耦合時間。如果必要的話,可以給所有單體額外的耦合反應(yīng)時間。
? 軟件簡單易用。在計算機或平板的Excel表中

詳細(xì)介紹

一、Oligo高通量DNA合成儀用于合成結(jié)構(gòu)上類似DNA或RNA的寡核苷酸的自動化儀器。一般應(yīng)用于固相合成法,每次將一個核苷酸加到所接長的寡核苷酸鏈上,加入每一個核苷酸都利用相同的化學(xué)反應(yīng)與相應(yīng)的嘌呤或嘧啶堿基衍生物作用。


二、Oligo高通量DNA合成儀的特點:

(1)包括一個靈活的合成協(xié)議編輯器,它允許操作員修改所包含的協(xié)議,并將它們保存在一個新名稱下,或者從頭開始編寫協(xié)議。協(xié)議編輯可以在Excel中完成。對于不同的合成規(guī)模和序列長度,很容易編輯特殊協(xié)議。比如,可以給耦合緩慢的堿基對一個特別的延長的耦合時間。如果必要的話,可以給所有單體額外的耦合反應(yīng)時間。

(2)軟件簡單易用。在計算機或平板的Excel表中創(chuàng)建運行數(shù)據(jù)后,可使用Wi-Fi等網(wǎng)絡(luò)連接或標(biāo)準(zhǔn)U盤傳輸?shù)絻x器上。實驗運行中,可以從PC端收集實驗數(shù)據(jù)監(jiān)測實驗結(jié)果。

(3)性能:

OligoMakerX12可以在1小時內(nèi)平行合成12條20對的寡核苷酸。  

OligoMaker48可以在2小時內(nèi)平行合成多達(dá)48條20對的寡核苷酸。  

OligoMaker96可以在3小時內(nèi)平行合成多達(dá)96條20對的寡核苷酸。  

OligoMaker192可以在4小時內(nèi)平行合成多達(dá)192條20對的寡核苷酸。  

(4)可在IUPAC-IUB標(biāo)準(zhǔn)規(guī)則下合成10、50、200和1000nmol規(guī)模的核苷酸。  

(5)兩個反應(yīng)盤,一個盤可以加載和合成核苷酸,另一個盤準(zhǔn)備進(jìn)行凈化步驟。  

OligoMaker48可以升級為OligoMaker96和OligoMaker192;  

OligoMaker96可以升級為OligoMaker192。  

(6)DNA的固相合成。即DNA3'端固定于基質(zhì)上,然后沿3'向5'方向依此添加核苷酸直至合成所需的DNA片段。不同于應(yīng)用DNA聚合酶的DNA合成。


三、合成過程:

*個堿基的3‘末端固定在樹脂上,下一個堿基的5’-OH用二對甲氧三苯甲基DMT保護,堿基上的氨基用苯甲酸保護,然后對3‘-OH用氨基磷酸化合物進(jìn)行活化。

1。1個堿基的5’-OH和下個堿基的3‘-OH形成亞磷酸三酯,  

2。然后用碘氧化成磷酸三酯  

3。加入C2H6CL2除去第二個堿基5’-OH上的保護劑DMT循環(huán)進(jìn)行加入下一個堿基合成完畢后  


四、亞磷酰胺寡核苷酸合成為例介紹該類儀器的一般操作步驟。亞磷酰胺DNA合成的試劑有:保護堿基的5/—DMT,A、G、C、T亞磷酰胺單體,四唑偶聯(lián)催化劑,乙酐,N—甲基咪唑封閉試劑,TCA脫保護溶液,12氧化混合物,乙腈清洗溶劑,氨水切除溶液。


五、使用步驟如下:

1、仔細(xì)檢查合成儀上所有試劑瓶中的試劑量,必要時換掉試劑瓶,特別注意乙腈的量,因為該溶劑用量較大。  

2、將標(biāo)記好的清潔的收集瓶裝在合成儀上。  

3、將要合成的DNA序列輸入合成儀。  

4、檢查選擇的合成步驟是否正確。  

5、選擇結(jié)束方法:TritylOffAuto是儀器的原始狀態(tài),若打算以5,—DMT基團連接純化寡核苷酸,將其轉(zhuǎn)變?yōu)門ritylOnAuto結(jié)束狀態(tài)。  

6、選擇結(jié)束方法,一般為系統(tǒng)的原始狀態(tài)。  

7、在每個柱監(jiān)視器的Username下,輸入你所希望的保存名字。  

8、以代碼代替相應(yīng)的DNA序列標(biāo)記每一個收集瓶。  

9、打印出每一個柱設(shè)置的詳細(xì)資料。  

10、檢查打印出來的資料是否正確。  

11、運行StartColumn步驟檢查每一個柱的位置,確保合成儀上合成柱處于正確的位置。  

12、檢查連接在合成儀上的溶劑殘留(廢液瓶)是否充滿。  

13、如果分部收集器用來收集每個DMT脫保護步驟的流出物,確保試管充分清潔干凈,并打開分部收集器,確保DMT廢液管路通向分部收集器。  

14、啟動循環(huán),運行開始程序清洗試劑管路,除去原來的試劑。


六、注意:TritylOnAuto表示在合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,并將其從固相載體上切下來,儲存在收集瓶中;TritylOffAuto表示在合成寡核苷酸的5,端核苷酸沒有保護基團,將其從固相載體上切下來,儲存在收集瓶中;TritylOnManual表示合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,而是保留在合成柱中;TritylOffManual表示在合成寡核苷酸的5,端核苷酸沒有保護基團,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,而是保留在合成柱中。

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