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泛素化實驗

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更新時間:2025-02-28 15:27:56瀏覽次數(shù):456次

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?E3連接酶篩選與驗證?

通過酵母雙雜交、GST Pull-down或CRISPR篩選技術(shù)發(fā)現(xiàn)候選E3酶,再通過體外/體內(nèi)泛素化實驗驗證其功能?17。
示例:研究KRAS突變時,發(fā)現(xiàn)USP25與RNF31調(diào)控KRAS的線性泛素化修飾?1。
?泛素鏈類型分析?

利用特異性泛素抗體(如K48、K63鏈抗體)或串聯(lián)泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域(TUBEs)區(qū)分泛素鏈連接方式?36。
  • ?體外泛素化實驗?

    • 使用重組表達的E1、E2、E3酶與底物蛋白,結(jié)合ATP、泛素分子進行反應(yīng),通過Western Blot檢測底物泛素化水平?26。

    • 常用試劑盒(如Ubiquitinylation Kit)可標(biāo)準(zhǔn)化操作流程?7。

  • ?體內(nèi)泛素化檢測?

    • 在細胞中過表達泛素、E3連接酶及底物蛋白,利用蛋白酶體抑制劑(如MG132)阻斷降解,通過免疫共沉淀(Co-IP)富集目標(biāo)蛋白后檢測泛素化信號?26。

  • ?泛素化位點鑒定?

    • ?質(zhì)譜法?

      :通過富集泛素化肽段,結(jié)合高分辨率質(zhì)譜確定具體修飾位點?45。

    • ?點突變驗證?

      :基于生物信息學(xué)預(yù)測(如UbiNet、GPS-Uber等工具),對潛在賴氨酸位點進行突變后觀察泛素化水平變化?47。


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